L'articolazione delle istituzioni e delle comunità ha consentito la tutela delle aree strategiche del dipartimento, territori di grande valore ecosistemico per via dei loro affluenti, come nel caso del bacino del fiume Camarones e di altri bacini diretti dei Caraibi.

Questo bacino è di singolare importanza poiché è la principale fonte d'acqua dolce della laguna costiera di Navio Quebrado., specchio d'acqua di alto valore ecologico e che forma parte integrante del Santuario della Fauna e della Flora di Los Flamencos. Ulteriormente, Il fiume Camarones è considerato un sistema di supporto vitale naturale e base per le attività produttive e socioculturali del bacino..

Nell'ambito dello studio del Piano di Gestione e Pianificazione del Bacino di Camarones condotto dal Ministero dell'Ambiente e dello Sviluppo Sostenibile, Corpoguajira e altre istituzioni che hanno stabilito che il bacino ha un'ampia gamma di nicchie ecologiche, rendendolo un ambiente ideale per la conservazione del 150 specie di uccelli (11 categoria di minaccia), 87 specie di mammiferi (6 categoria di minaccia), 27 specie di anfibi, 58 specie di rettili (7 categoria di minaccia) e 54 specie di pesci (3 categoria di minaccia).