L'articulation des institutions et des collectivités a permis la protection des zones stratégiques du département, territoires de grande valeur écosystémique en raison de leurs affluents, comme le cas du bassin de la rivière Camarones et d'autres bassins directs des Caraïbes.

Ce bassin revêt une importance singulière puisqu'il constitue la principale source d'eau douce de la lagune côtière de Navío Quebrado., plan d'eau de haute valeur écologique et qui fait partie intégrante du sanctuaire de faune et de flore de Los Flamencos. En outre, La rivière Camarones est considérée comme un système naturel de survie et une base pour les activités productives et socioculturelles dans le bassin..

Dans le cadre de l'étude du Plan de Gestion et d'Aménagement du Bassin de Camarones réalisée par le Ministère de l'Environnement et du Développement Durable, Corpoguajira et d'autres institutions qui ont établi que le bassin possède un large éventail de niches écologiques, ce qui en fait un cadre idéal pour la conservation de 150 espèces d'oiseaux (11 dans la catégorie de menace), 87 espèces de mammifères (6 dans la catégorie de menace), 27 espèces d'amphibiens, 58 espèces de reptiles (7 dans la catégorie de menace) et 54 espèces de poissons (3 dans la catégorie de menace).