A articulação de instituições e comunidades tem permitido a proteção de áreas estratégicas do departamento, territórios de grande valor ecossistêmico devido aos seus afluentes hídricos, como é o caso da bacia do rio Camarones e outros diretos do Caribe.

Esta bacia tem uma importância singular, pois é a principal fonte de água doce da lagoa costeira de Navío Quebrado., corpo de água de alto valor ecológico e que faz parte integrante do Santuário de Fauna e Flora Los Flamencos. também, O rio Camarones é considerado um sistema natural de suporte à vida e base para atividades produtivas e socioculturais na bacia..

No âmbito do estudo do Plano de Gestão e Ordenamento da Bacia de Camarones realizado pelo Ministério do Meio Ambiente e Desenvolvimento Sustentável, Corpoguajira e outras instituições que estabeleceram que a bacia possui uma ampla gama de nichos ecológicos, tornando-a um cenário ideal para a conservação de 150 especies de aves (11 na categoria de ameaça), 87 espécies de mamíferos (6 na categoria de ameaça), 27 espécies de anfíbios, 58 espécies de répteis (7 na categoria de ameaça) e 54 espécies de peixes (3 na categoria de ameaça).